“工藤先生，我在地下室的垃圾收集场里，找到了由纸箱还有铝箔纸所做成的短刀。”
千叶警官看了眼面色大变的辛多拉，兴奋的说道：“正如工藤先生所说的一样，上面有诸星秀树和辛多拉董事长两人的指纹。”
工藤优作露出笑容大局已定的笑容，言之凿凿的说道：“如果在那柄假的短刀上，沾有少年之外的人的指纹，那一定就是犯人的指纹。”
“胡说八道，我要向日本政府抗议，况且我根本就没有动机要去杀害坚村！”辛多拉已经不肯承认自己的罪行，还在做着最后的挣扎。
工藤优作并没有在意，笑着反问道：“听说铜像的那把短刀，是辛多拉家族历代家传的古董宝贝，是吧？”
“没错，那又怎么样？”辛多拉点头承认下来。
工藤优作紧紧的盯着辛多拉的眼镜，步步紧逼的问道：“这样的短刀，你为什么要拿来做凶器呢？或者说，为什么凶器一定要是这把短刀呢？如果这样假设的话…”
……
与此同时，游戏里的柯南和诸星秀树，也来到了火车的车顶，见到了被开膛手杰克捆绑起来的小兰。
看着面带疯狂之色的开膛手杰克，柯南冷声问道：“开膛手杰克，你已经杀死了你母亲，报了多年的怨恨后，现在你还想要什么？”
“哈哈哈哈！”
开膛手杰克用绳子将他和小兰连在一起，癫狂的大笑道：“我想要活下去，让流在我体内的凶恶之血，乘着诺亚方舟流传到下个世纪。”
……
监控室中，众人也听到了开膛手杰克的话语。
“辛多拉先生，这就是你杀害坚村的动机吧。”
工藤优作已经看透了一切，开口说道：“开膛手杰克的血脉，仿佛是被推上诺亚方舟一般，一直存活到了现代，所以，你就是开膛手杰克的子孙，对不对?“
“什么？！开膛手杰克的后代？！”目暮警部等人闻言大惊失色，没想到辛多拉竟然会是传奇故事人物的后代。
“作为IT业界的龙头，居然是百年前连续杀人魔的后代，要是被世人知道的话，你就会失去一切。”
工藤优作叹息一声，继续说道：“弘树可能是通过DNA追踪系统得知了这件事，所以为了灭口，你逼迫弘树自杀，还杀害了坚村。”
“那是弘树来看我的收藏品的时候，对这把短刀产生了兴趣，从里面检测出哈妮·查尔斯特的DNA和我的一致，所以...”
听完工藤优作的推论后，辛多拉愧疚的低下脑袋，承认下自己的作案动机，痛苦的说道：“我很害怕流淌在我体内的这种可怕的罪人之血...”
工藤优作很是恼火，哀其不幸怒其不争的喝骂道：“杀人魔的血又怎么样？世人怎么看你又怎么样？你为什么不去加以抵抗呢？”
辛多拉痛苦的捂着脑袋，一切都已经太迟了，他的双手也向先辈一样，沾染了无法洗刷的罪孽之血。
“辛多拉先生，我以杀害坚村忠彬的嫌疑犯的罪名逮捕你。”
犯罪事实确定下来之后，白鸟警官掏出手铐，将辛多拉逮捕归案。
现实世界里的案件破解完毕，众人的目光再次转回显示屏，紧张的关注着柯南与开膛手杰克的对决。
……
高速行驶的火车车顶上，赤手空拳的柯南和诸星秀树，艰难的躲避着开膛手杰克的袭击。
可惜柯南毕竟是孩子的体型，阿笠博士的发明又无法在游戏中使用，在开膛手杰克的攻击下显得十分狼狈。
“光只会逃的话，是抓不到我的哦，有十分钟就到终点站了，无人驾驶的列车会变成怎么样呢？”
开膛手杰克狞笑着走向柯南，正准备将他杀害的时候，小兰做出一个大胆而勇敢的决定，从车顶一跃而起，连带着和她绑在一条绳子上的开膛手杰克坠入悬崖，挽救了柯南在游戏世界里的性命。
不过虽然解决了开膛手杰克的问题，但火车还在高速行驶，如果不把火车停下，让他们两人存活下去的话，还不算是赢了这场游戏。
火车还在不断的加速，距离终点站只剩下不到五分钟的时候，再加上火车的刹车被破坏，唯一的方法只有切断火车头和客厢的连接部分。
然而小兰已经在跳车后从游戏世界消失，火车里的乘客也被诺亚方舟歌给变没了，只靠柯南和诸星秀树这两个小孩子的力量，根本就做不到这一点。
就在柯南放弃的时候，福尔摩斯突然出现在柯南面前，给予柯南鼓舞和破解危局的提醒。
重新振作起来的柯南，带着诸星秀树前往火车车尾处的货运车厢，用挂在车厢里的消防斧，将车厢里存放着红酒的橡木桶全都打碎，任由流出的酒液充满大半个车厢。
很快，火车抵达终点站，没有做任何减速操作的火车头直接冲出车站的轨道，撞击在车站的建筑物里。
“轰隆...”
在剧烈的撞击下，所有的车厢全都翻滚颠簸起来，将身体潜入酒液里的柯南和诸星秀树，跟随车厢一同翻滚，好在有酒液作为缓冲，成功的幸存下来，完成了这个游戏世界的任务，被传送回选择游戏世界的大厅里。
而后，柯南通过游戏里的蛛丝马迹，推理出和他一起行动的诸星秀树，其实是诺亚方舟的制造者弘树伪装的。
弘树的目的也不是通过抹杀霓虹未来一代而让霓虹重生，而是期望他们能够不借助父母的力量，克服游戏里的困难获得成长，从而让霓虹在他们的带领下，创造出更美好的未来。
当一切都真相大白之后，诺亚方舟将柯南和其他的孩子们送去游戏，正准备启动自我毁灭程序时，白岩真羽成功破解了诺亚方舟的核心程序，阻止了它的自我毁灭。
“原来如此，难怪我会有一种熟悉的感觉。”
等白岩真羽彻底掌握了诺亚方舟后，才知道熟悉感的由来，原来诺亚方舟的制造者弘树，就是一直在网络上指导他计算机技术的树大佬。
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